172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2660 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  100 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 416 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 422 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  38.86 
 
 		 415 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 405 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 		 415 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 408 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 442 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 419 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  38.6 
 
 		 395 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  38.42 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  33.53 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 409 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.31 
 
 		 434 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 404 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 387 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.42 
 
 		 430 aa  61.6  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 387 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.48 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.5 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 441 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.59 
 
 		 435 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  32.53 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  29.75 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  29.75 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 430 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 404 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 442 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 405 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 433 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 457 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 432 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 435 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.11 
 
 		 423 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 423 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 422 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 409 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 400 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 442 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 424 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 393 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 391 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  28.21 
 
 		 395 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 410 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 428 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 410 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 429 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 416 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 410 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.83 
 
 		 425 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 410 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 426 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 411 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 459 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 414 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 411 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 427 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 400 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 427 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 427 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 427 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 410 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 432 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 432 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>