132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0327 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  763    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  56.75 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  54.96 
 
 		 397 aa  338  9e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  54.32 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  52.7 
 
 		 393 aa  325  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 426 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 391 aa  227  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  35.58 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 402 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  31.98 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  29.81 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  31.5 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  31.83 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  32.15 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 433 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  30.47 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  32.32 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  25.98 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 486 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254486  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  22.19 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.44 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  24.29 
 
 		 451 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.41 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  25.13 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  25.13 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  27.22 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 539 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  22.99 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  25.13 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>