More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1407 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  75.21 
 
 		 496 aa  732    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  75.62 
 
 		 496 aa  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  75.21 
 
 		 496 aa  733    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  75.21 
 
 		 496 aa  732    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  75.31 
 
 		 496 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  75 
 
 		 496 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  75 
 
 		 496 aa  730    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  75.62 
 
 		 496 aa  735    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  75.31 
 
 		 496 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  75.31 
 
 		 496 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  75.31 
 
 		 496 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  99.8 
 
 		 510 aa  1015    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  75.31 
 
 		 496 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  99.8 
 
 		 510 aa  1015    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  74.48 
 
 		 495 aa  719    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  75.21 
 
 		 496 aa  732    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  75.21 
 
 		 496 aa  732    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  100 
 
 		 510 aa  1018    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  54.07 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  37.14 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  37.14 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  37.14 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  36.09 
 
 		 426 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  36.09 
 
 		 426 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  34.7 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 431 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.18 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  29.18 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.18 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  29.18 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.18 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.18 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.18 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 406 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  28.06 
 
 		 408 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 416 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 423 aa  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.23 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.23 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 411 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  26.87 
 
 		 428 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.51 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  26.25 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  25.28 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  25.74 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  25.28 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 417 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  24.89 
 
 		 417 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  25 
 
 		 433 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 417 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 433 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 425 aa  133  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  25.63 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 425 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.23 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 434 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 429 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  27.67 
 
 		 422 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 415 aa  126  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 409 aa  123  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>