88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2449 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  743    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  66.38 
 
 		 369 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 		 426 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 404 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  40.06 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  36 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  36.69 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  29.85 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  30.99 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  28.3 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  30.28 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  31.44 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  30.08 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  29.46 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.15 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.88 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.3 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  24 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.82 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.42 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 437 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 437 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  22.86 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>