67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0642 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  747    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  65.99 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  50.82 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  39.02 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 408 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 426 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  30.28 
 
 		 416 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 393 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  30.88 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  31.37 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  28.92 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  27.55 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  31.52 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  30.49 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  30 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  30.71 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  32.93 
 
 		 216 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  30.18 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>