86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1229 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  792    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  54.7 
 
 		 369 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  50.96 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 426 aa  279  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 411 aa  279  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 397 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 408 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  38.68 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  35.18 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 411 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  30.64 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  30.4 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  27.5 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 399 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 408 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  26.34 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  25.62 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  27.73 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  26.82 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  25.82 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.63 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  20.98 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.24 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  24.03 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  22.12 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  24.42 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  28.99 
 
 		 216 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  27.78 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  23 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  20.8 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>