207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0648 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  82.2 
 
 		 410 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  796    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  36.62 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 432 aa  213  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 397 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  40 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  34.97 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  35.03 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  35.44 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  36.54 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  39.15 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 391 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  33.78 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  32.61 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  32.38 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  31.25 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  34.78 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  25.88 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.25 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.06 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  21.66 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.52 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  23.8 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>