241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0308 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  839    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  33.25 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 441 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  28.23 
 
 		 439 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  28.01 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  35.62 
 
 		 184 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.05 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  25.93 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.8 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.25 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.32 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  25.83 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23.86 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  25.17 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  23.15 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  24.83 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  21.63 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.86 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  26.47 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  23.51 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  21.26 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.02 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.02 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14780  sugar phosphate permease  25.75 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.024314 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  23.48 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  23.62 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>