23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14780  sugar phosphate permease  100 
 
 		 414 aa  822    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.024314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.7 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.96 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.43 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  22.19 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.2 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3259  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  23.41 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>