More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1866 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  836    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 434 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  43.66 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  40.35 
 
 		 413 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  39.5 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 421 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 462 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 426 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  31.31 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 438 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 425 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  26.73 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 440 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  23.88 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  23.88 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  26.94 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.16 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.57 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  21.53 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.13 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.25 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  27.53 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.25 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>