More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0424 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  92.69 
 
 		 424 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  784    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  88.08 
 
 		 439 aa  631  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  92.88 
 
 		 423 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  92.88 
 
 		 423 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  92.35 
 
 		 422 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  88.18 
 
 		 459 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  67.63 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  33.07 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 486 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.32 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.4 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.37 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  30.17 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  27.75 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.95 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.67 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.85 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  29.94 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  24.59 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.95 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.52 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.19 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.28 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  29.4 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.6 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.05 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.34 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>