More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1507 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  834    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 426 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.18 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.24 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23.79 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  27.58 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.15 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  26.23 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.16 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.51 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  25 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  26.3 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.92 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  24.92 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  24.51 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  24.61 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5076  major facilitator superfamily permease protein  26.3 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5218  Permeases of the major facilitator superfamily  23.62 
 
 		 496 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.89 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  22.89 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.52 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>