More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2251 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  868    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 441 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  33.25 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  32.9 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1791  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0460445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0990  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 445 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.72949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.74 
 
 		 434 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 408 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 426 aa  86.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.48 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  27.99 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  24.81 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.58 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.52 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5218  Permeases of the major facilitator superfamily  32.29 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23.4 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  23.08 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  25.89 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  25.89 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  27.81 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  25.64 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  26.2 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.09 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  23.33 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  23.38 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>