More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3099 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  851    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  58.06 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 408 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8475  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.35 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 408 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.62 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  27.16 
 
 		 500 aa  87  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.39 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 486 aa  86.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.95 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.14 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25.74 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.63 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.18 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  26.94 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  25.13 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.01 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  22.4 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  22.4 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  24.47 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  25.87 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.13 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  23.85 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 401 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0639  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  25 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  22.39 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>