More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0267 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
441 aa  865    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
421 aa  192  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
412 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
422 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
426 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  30.02 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  32.25 
 
 
439 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
432 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  26.9 
 
 
415 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  27.96 
 
 
500 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  37.06 
 
 
184 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.38 
 
 
418 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.9 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
430 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.82 
 
 
420 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.95 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.99 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.19 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  29 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  30.31 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.89 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  26.77 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  25.41 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  29.5 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.08 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  23.84 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  22.94 
 
 
486 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  26.56 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  24.21 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  31.15 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.61 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  27.84 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.23 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  27.32 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.48 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.26 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  23.6 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  25.48 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
405 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  25.38 
 
 
402 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.61 
 
 
430 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  26.33 
 
 
410 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  25.83 
 
 
414 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.96 
 
 
427 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
433 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  26.44 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.6 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 
417 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  28.5 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23 
 
 
429 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0055  conjugated bile Salt transporter  21.54 
 
 
451 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  28.16 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  29.77 
 
 
414 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.52 
 
 
409 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  27.8 
 
 
420 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.52 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  23.3 
 
 
412 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  28.52 
 
 
416 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.89 
 
 
402 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.89 
 
 
402 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.85 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.36 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  26.1 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
404 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.55 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  27.47 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  24.93 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.81 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
422 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.35 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  27.88 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  27.88 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  21.11 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  25.37 
 
 
439 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.92 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  22.89 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.7 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>