249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10510 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 500 aa  1000    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  25.56 
 
 		 415 aa  103  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  25 
 
 		 421 aa  100  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  33.54 
 
 		 184 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.05 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 426 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 432 aa  86.7  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.09 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  28.2 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.49 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  26.83 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 422 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0055  conjugated bile Salt transporter  23.48 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.38 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 416 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 400 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  24.51 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  26.9 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  22.87 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  26.4 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 417 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  25.89 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 421 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  24.58 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>