65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2675 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  100 
 
 		 411 aa  815    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  50 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  33.98 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.99 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2570  hypothetical protein  24.9 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2424  hypothetical protein  24.08 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  24.08 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.88 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  25.53 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2912  putative transporter  25.53 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2698  transporter  24.11 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  24.11 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2896  transporter  24.11 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  24.11 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  22.98 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  28.28 
 
 		 683 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  25.42 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  24.11 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  24.11 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  24.81 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 417 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  25.19 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 458 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  20.72 
 
 		 416 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>