More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1355 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 390 aa  740    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  69.49 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  68.72 
 
 		 390 aa  507  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  60.99 
 
 		 391 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  58.21 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  55.18 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  54.01 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2345  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.205861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  27.81 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.86 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  21.75 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  21.75 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  23.53 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.88 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2076  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  24.58 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1257  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.375741  hitchhiker  0.00856521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  24.82 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  31.55 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  24.02 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  24.02 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  27.05 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  24.02 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  24.02 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  24.02 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  24.02 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  27.27 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  24.02 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  26.62 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  26.62 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  26.62 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  21.33 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>