More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7103 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
458 aa  877    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  46.53 
 
 
446 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  45.52 
 
 
447 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  45.05 
 
 
447 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
445 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  43.87 
 
 
447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  45.85 
 
 
446 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  45.61 
 
 
446 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  39.91 
 
 
444 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  44.85 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  42.96 
 
 
435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  41.1 
 
 
450 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  44.09 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  44.5 
 
 
487 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  38.31 
 
 
432 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  36.7 
 
 
445 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 
444 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  32 
 
 
454 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  30.41 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.94 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
432 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  32.51 
 
 
406 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
446 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.97 
 
 
451 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  31.11 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  32.72 
 
 
453 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  32.72 
 
 
453 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  32.66 
 
 
468 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.51 
 
 
438 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  30.94 
 
 
452 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  32.89 
 
 
453 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  30.7 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  35.66 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  32.27 
 
 
447 aa  173  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  33.17 
 
 
449 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  34.13 
 
 
441 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  32.66 
 
 
457 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.72 
 
 
452 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.72 
 
 
452 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  32.05 
 
 
458 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  32.63 
 
 
453 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 
454 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  28.54 
 
 
452 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.38 
 
 
453 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.58 
 
 
454 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  31.72 
 
 
453 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  29.91 
 
 
449 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.14 
 
 
453 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  33.33 
 
 
453 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  32.75 
 
 
448 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  29.87 
 
 
452 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  33.1 
 
 
410 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 
439 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  31.08 
 
 
442 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  34 
 
 
447 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.07 
 
 
465 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  29.57 
 
 
446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  30.66 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  30.66 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.09 
 
 
452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
447 aa  166  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  31.19 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.09 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  30.66 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  29.28 
 
 
454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  31.39 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.7 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  31.36 
 
 
461 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  31.3 
 
 
465 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  30.68 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  30.68 
 
 
442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
452 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0708  4-hydroxybenzoate transporter, putative  32.66 
 
 
464 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0289026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  32 
 
 
449 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  32.61 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  32.61 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  31.31 
 
 
440 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  32.61 
 
 
451 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.61 
 
 
451 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  31.61 
 
 
452 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  32.61 
 
 
451 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.61 
 
 
451 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  30.87 
 
 
465 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  32.61 
 
 
451 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  31.32 
 
 
456 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.82 
 
 
410 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
463 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  31.06 
 
 
453 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.29 
 
 
452 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  30.37 
 
 
465 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  32.62 
 
 
467 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.48 
 
 
461 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  30.14 
 
 
460 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
448 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  28.22 
 
 
454 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  31.58 
 
 
530 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  32.77 
 
 
467 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>