51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1523 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  824    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  50 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 409 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  32.54 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 412 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.53 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  29.82 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  27.03 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  29.88 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  25.95 
 
 		 184 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.84 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  22.18 
 
 		 459 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  23.48 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  25.81 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2570  hypothetical protein  22.66 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  24.85 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2424  hypothetical protein  22.36 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  22.78 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 456 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 		 520 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  27.1 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  21.99 
 
 		 468 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  23.81 
 
 		 445 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  23.81 
 
 		 445 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>