More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0515 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.82 
 
 		 520 aa  872    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 520 aa  1056    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  76.62 
 
 		 518 aa  814    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.13 
 
 		 501 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.98 
 
 		 513 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.41 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.71 
 
 		 527 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.01 
 
 		 527 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.39 
 
 		 526 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.31 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.28 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.92 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.4 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.34 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.88 
 
 		 508 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.18 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.74 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.48 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.37 
 
 		 509 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  48.22 
 
 		 534 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.68 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.38 
 
 		 512 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.62 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.31 
 
 		 507 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  46.94 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.67 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  47.33 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.33 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  44.64 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.64 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.43 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.31 
 
 		 529 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.63 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.04 
 
 		 509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  37.42 
 
 		 561 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 511 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.82 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.3 
 
 		 537 aa  329  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 		 521 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 		 532 aa  325  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.77 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 517 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 		 500 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 526 aa  319  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38 
 
 		 510 aa  316  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.86 
 
 		 529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 530 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 530 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.25 
 
 		 514 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 530 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  33.6 
 
 		 539 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.6 
 
 		 539 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.6 
 
 		 539 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  36.89 
 
 		 526 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.66 
 
 		 526 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 539 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 530 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  33.4 
 
 		 539 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  32.59 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  33.4 
 
 		 539 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  33.4 
 
 		 539 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  32.74 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 522 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.94 
 
 		 534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.94 
 
 		 534 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 		 530 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 		 526 aa  300  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.71 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 		 532 aa  296  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 519 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 511 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 511 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 		 511 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 511 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  33.4 
 
 		 511 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  33.4 
 
 		 511 aa  276  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  33.19 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  33.19 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  32.96 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  32.96 
 
 		 512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 515 aa  274  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  32.16 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.16 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  32.16 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
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NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  32.16 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  32.16 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  32.16 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  32.16 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
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NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  32.74 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  31.92 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.06 
 
 		 536 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 		 518 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
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