More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0655 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  779    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  48.21 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  39.27 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 422 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 439 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.4 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.95 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  31.82 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.19 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.19 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  33.63 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.19 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.38 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  33.63 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  30.46 
 
 		 528 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  25.99 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  27.6 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  28.61 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  24.8 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  24.8 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  24.8 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  25.45 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.45 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  24.8 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  24.8 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  30.2 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  27.09 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  30.61 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  24.37 
 
 		 487 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  28.49 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  29.47 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  24.61 
 
 		 445 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.19 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 407 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  27 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  25.47 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  24.68 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  24.68 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  27.86 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>