More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6790 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  93.53 
 
 		 404 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  76 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  64.23 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  55.28 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  55.39 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  54.11 
 
 		 410 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  55.14 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  55.03 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  54.46 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  55.03 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  53.81 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  51.38 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  32.85 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 411 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  33.23 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 416 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.51 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 424 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.62 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  26.32 
 
 		 506 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  23.79 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  29.33 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.97 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  26.65 
 
 		 528 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  25.92 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.61 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  24.01 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  24.3 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  26.92 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  26.92 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  26.92 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  26.92 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  26.92 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  26.92 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  26.12 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  26.92 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  21.55 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.31 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>