More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6515 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 412 aa  804    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  72.04 
 
 		 414 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  68.13 
 
 		 411 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  69.27 
 
 		 416 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  71.61 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  62.24 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  57.68 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  58.22 
 
 		 414 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  53.85 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  53.06 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 404 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 408 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  30.25 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.56 
 
 		 434 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.44 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.92 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  24.38 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.77 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.4 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  26.27 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  25 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.04 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  24.69 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  32.57 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  21.85 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  26 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  24.49 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  24.46 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  20.69 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.07 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  23.15 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  23.73 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  23.73 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>