More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3782 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 415 aa  792    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  61.18 
 
 		 418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  29.81 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  25.86 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  29.11 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  25.08 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  26.63 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  25.4 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  25.74 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  25.74 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  25.74 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.77 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.77 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  25.74 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  25.44 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.44 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  24.74 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  24.74 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  27.92 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 442 aa  92.8  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.38 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.38 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  24.56 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  24.47 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  26.67 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  24.71 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  23.6 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.13 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  28.46 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.1 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.49 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  26.85 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.25 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.62 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  26.87 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>