288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0480 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  803    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  28.82 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  32.98 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 449 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.3 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  27.59 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.18 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  25.71 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  26.63 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  26.36 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  32.96 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  23.91 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  24.2 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.74 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  25.86 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  24.1 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.84 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.39 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.04 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.47 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  25 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  27.7 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  24.87 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  23.4 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  25.78 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  27.02 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>