263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0351 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 415 aa  822    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  43.86 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  38.02 
 
 		 439 aa  253  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 431 aa  122  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 421 aa  107  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  35.37 
 
 		 184 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  25.31 
 
 		 500 aa  95.5  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 486 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  26.48 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.32 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.32 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  24.18 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  23 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  20.87 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  27.05 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  21.21 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0055  conjugated bile Salt transporter  22.68 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  20.79 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  24.45 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  21.26 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  23.17 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  24.45 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  26.67 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  24.18 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  22.41 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 427 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.23 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27.67 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  20.8 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  23.4 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.79 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.18 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.18 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  20.83 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  23.04 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  23.96 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  23.96 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  22 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  25.91 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.11 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>