144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0414 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  855    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
441 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
431 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 
426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
420 aa  107  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
421 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  23.1 
 
 
439 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  22.71 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  24.74 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  26.78 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.85 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  31.64 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  26.23 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.84 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.78 
 
 
435 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.21 
 
 
427 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.39 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  22.7 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.12 
 
 
436 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.94 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
472 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
409 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
442 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.04 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25 
 
 
429 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.72 
 
 
430 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 
437 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
433 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.09 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  27.57 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  24.91 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  23.81 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  23.57 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 
427 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
422 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.13 
 
 
439 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  22.11 
 
 
414 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.92 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  28.33 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  24.62 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  23.46 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  21.45 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  29.36 
 
 
457 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 
433 aa  54.3  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  24.75 
 
 
401 aa  53.5  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  29.39 
 
 
422 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  25.15 
 
 
427 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  30.58 
 
 
486 aa  53.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  23.88 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.91 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 
421 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  22.33 
 
 
412 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.4 
 
 
430 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  21.22 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  21.92 
 
 
432 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
441 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  21.91 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  23.42 
 
 
411 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  23.32 
 
 
424 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  25.2 
 
 
400 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  34 
 
 
424 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
402 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  28.18 
 
 
427 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  27.74 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  20.74 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  28.18 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  24.14 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  22.9 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  22.86 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 
414 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  25.49 
 
 
428 aa  47  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  24.79 
 
 
412 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  22.88 
 
 
441 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  20.86 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>