More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4524 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  846    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 428 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  34.78 
 
 		 436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 448 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 438 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 428 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 431 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 444 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.51 
 
 		 429 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  31.29 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.31 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  25.31 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  25.06 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  25.06 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  25.06 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 425 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 429 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 430 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.57 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.27 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.68 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  26.18 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 429 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 446 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  26.13 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  26.09 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 431 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  24.37 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  24.37 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  24.18 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  28.78 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  25.19 
 
 		 463 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  28.78 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  26.08 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  28.78 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  26.08 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  26.08 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  25.89 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>