More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2715 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 429 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 438 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 431 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  44.08 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 428 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  41.3 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  36.39 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 441 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.02 
 
 		 448 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 433 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 435 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.07 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  29.61 
 
 		 441 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  28.16 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.64 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.61 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.63 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.04 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  27.07 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.26 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 430 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 430 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 435 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 425 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.49 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 443 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 435 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  27.64 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.46 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.19 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  24.24 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  30.5 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  25.07 
 
 		 432 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>