More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0221 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  838    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 448 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.73 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 440 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 438 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 428 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 431 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  33.73 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 432 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  33.88 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 474 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  30.52 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.93 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.05 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  24.36 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  24.71 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.02 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 461 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 479 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.89 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2275  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 418 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  26.78 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.2 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  24.04 
 
 		 445 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.57 
 
 		 434 aa  90.1  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.16 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.81 
 
 		 446 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  22.28 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49086  MFS family transporter: sugar (sialic acid)  25.8 
 
 		 506 aa  87.4  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0133076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 430 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 436 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  24.24 
 
 		 428 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  24.24 
 
 		 428 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  24.24 
 
 		 428 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  24.24 
 
 		 428 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>