More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2275 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2275  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 418 aa  821    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 435 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 450 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.55 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.23 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 442 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  28.18 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  27.06 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  29.2 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  28.72 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  29.23 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  29.23 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  25.35 
 
 		 453 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.25 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  27.75 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  29.5 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  28.72 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  28.72 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  28.72 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  29.63 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  28.72 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 432 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  27.67 
 
 		 429 aa  136  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  26 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25.69 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  26 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  26.5 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  26.5 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  26.5 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  25.75 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  26.5 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  26.5 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  25.75 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  26.5 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  26.5 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  26.5 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  27.05 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  27.98 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  27.11 
 
 		 450 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  29.21 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 450 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  25.17 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  28.43 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.16 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.98 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  29.4 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  28.43 
 
 		 478 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  29.5 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  26.1 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  26.87 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  26.87 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  26.87 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  26.87 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  28.67 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  28.09 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  26.87 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  24.71 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  27.74 
 
 		 485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  24.71 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 449 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  24.71 
 
 		 453 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 449 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  26.1 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  27.18 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 432 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  28.82 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.05 
 
 		 456 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  26.78 
 
 		 430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>