More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2612 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  857    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  44.18 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  32.78 
 
 		 454 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  32.78 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  32.78 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  32.78 
 
 		 453 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  32.62 
 
 		 461 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.42 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  33.02 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  32.39 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  33.25 
 
 		 463 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 467 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  34.94 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2275  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  32.6 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 450 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  34.62 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  33.64 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 443 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  32.96 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  33.11 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  33.11 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  33.11 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  33.11 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  33.11 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  33.11 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  33.11 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  30.35 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  32.55 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.96 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  32.86 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  31.68 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 419 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  32.44 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  32.44 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  32.44 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  32.08 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  32.44 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  32.44 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  32.63 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  31.29 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 436 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  33.66 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  33 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  33 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  33 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  30.05 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  31.19 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  31.19 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  31.19 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  32.6 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  31.19 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  31.19 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  31.19 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  31.69 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  31.19 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  31.19 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  29.48 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.52 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.52 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  32.52 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.52 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.52 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.52 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  32.52 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  30.54 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  31.19 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  31.1 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  31.43 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  29.67 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  31.43 
 
 		 446 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  29.67 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  30.35 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  32.52 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  29.43 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  31.26 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  34.84 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  30.02 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.06 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.78 
 
 		 456 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  30.75 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  30.75 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 463 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>