More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3034 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  860    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  34.13 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 435 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  33.92 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  33.56 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  30.88 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  30.38 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.54 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  28.92 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.7 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  30.38 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.77 
 
 		 448 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.02 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 431 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  29.09 
 
 		 468 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  30.77 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.77 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  30.77 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  30.77 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  30.77 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  30.77 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  30.77 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  30.55 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  30.9 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  29.33 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  29.18 
 
 		 463 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  28.41 
 
 		 461 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  27.57 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.34 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  27.57 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 439 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  27.95 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  27.48 
 
 		 453 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  30.07 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  27.35 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.21 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  29.05 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  30.61 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  30.61 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  29.05 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  30.37 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  30.61 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  29.45 
 
 		 453 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  29.05 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 439 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 432 aa  156  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  26.81 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>