More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7255 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 448 aa  894    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 428 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 431 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 434 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  42.01 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  38.81 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 432 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.42 
 
 		 429 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  37.35 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 474 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  25.69 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 429 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 447 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  27.61 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 428 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.76 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 420 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.73 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  28 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  25.67 
 
 		 436 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25.79 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  25.46 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  25.45 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  26.3 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  24.06 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  24.94 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  24.43 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  24.43 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  24.43 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  24.81 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  24.26 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  23.63 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  21.33 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  23.37 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  21.33 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  21.33 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  21.11 
 
 		 428 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  25.16 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  25.16 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 425 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 479 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  25.85 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  21.11 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  24.28 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  23.13 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  23.62 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  24.28 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  23.91 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  26.95 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  26.95 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  24.28 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  23.24 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  26.38 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>