122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1941 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1941  putative permease  100 
 
 		 421 aa  837    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  44.13 
 
 		 415 aa  303  5.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  35.87 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  25.31 
 
 		 500 aa  96.3  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 426 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  32.91 
 
 		 184 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  24.68 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  23.02 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  20.88 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.31 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.46 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  22.36 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  23.27 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  20.68 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  24.73 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  24.73 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  25.48 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  23.18 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  23.9 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0990  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.72949 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.37 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  31.11 
 
 		 506 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.73 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  23.12 
 
 		 216 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  24.73 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  31.46 
 
 		 606 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  19.59 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>