84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0990 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0990  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  880    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.72949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 417 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1791  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 432 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0460445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  27.01 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.5 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  20.66 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  20.49 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  21.74 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  23.72 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 517 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  23.8 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  22.48 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 398 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  20.95 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.27 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.23 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 515 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  23.39 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  23.39 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  21.09 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  22.48 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  24.5 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.04 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  24.65 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0891  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891594  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0055  conjugated bile Salt transporter  22.66 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  22.46 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0920  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.732822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 406 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  23.05 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1000  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 510 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 510 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03041  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01480)  23.2 
 
 		 542 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>