220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0891 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  93.12 
 
 		 510 aa  976    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  84.62 
 
 		 514 aa  880    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  83.07 
 
 		 517 aa  848    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  84.68 
 
 		 514 aa  880    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  84.48 
 
 		 514 aa  880    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  81.85 
 
 		 511 aa  843    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0891  major facilitator transporter  100 
 
 		 510 aa  1033    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1000  major facilitator transporter  93.91 
 
 		 510 aa  984    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2924  major facilitator transporter  84.81 
 
 		 514 aa  885    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  84.26 
 
 		 512 aa  871    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1341  major facilitator transporter  85.01 
 
 		 513 aa  883    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0920  major facilitator transporter  91.36 
 
 		 512 aa  957    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.732822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  84.62 
 
 		 513 aa  883    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  83.83 
 
 		 513 aa  874    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3017  major facilitator superfamily MFS_1  84.62 
 
 		 513 aa  880    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227562  normal  0.425104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2005  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.685164  hitchhiker  0.0000601576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 573 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2104  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 573 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  34.98 
 
 		 604 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0597  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3854  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  22.51 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1064  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.902671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  34.93 
 
 		 498 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.22 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  21.82 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 497 aa  67  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  22.57 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.24 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  26.95 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  28.45 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  25.29 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  27.02 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  28.48 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  27.49 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  32.14 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  24.71 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  30.38 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  26.97 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  27.27 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  27.65 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  21.82 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  27.65 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  21.82 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  21.82 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  29.89 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  21.82 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  27.98 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  27.78 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.33 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.33 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.14 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  31.06 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.77 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  24.77 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0685  di-/tripeptide transporter  26.23 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.284877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  30.23 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.77 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  29.29 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  21.91 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  28.05 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  28.05 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  28.12 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  30.26 
 
 		 501 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  20.36 
 
 		 442 aa  57  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 501 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  29.01 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  27.92 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  27.82 
 
 		 489 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  28.25 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  24 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  28.66 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  24 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  27.78 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  22.44 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  26.23 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  21.66 
 
 		 398 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  25 
 
 		 533 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  26.34 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  20 
 
 		 401 aa  54.3  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  26.8 
 
 		 489 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  25.1 
 
 		 501 aa  53.5  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 426 aa  53.5  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  26.01 
 
 		 507 aa  53.9  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  34 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  34 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>