298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2746 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
482 aa  939    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  86.93 
 
 
482 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  53.94 
 
 
486 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  52.75 
 
 
484 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  52.26 
 
 
489 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  50.95 
 
 
511 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  46.89 
 
 
498 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  42.59 
 
 
495 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  40.97 
 
 
497 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  43.06 
 
 
497 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  40.7 
 
 
490 aa  346  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  40.86 
 
 
483 aa  338  9e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  45.24 
 
 
509 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  39.92 
 
 
499 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  40.13 
 
 
497 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  37.08 
 
 
499 aa  327  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  40.69 
 
 
496 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  37.25 
 
 
498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  37.55 
 
 
501 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  37.55 
 
 
501 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  37.78 
 
 
501 aa  300  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  36.86 
 
 
501 aa  292  8e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  36.44 
 
 
497 aa  285  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  33.94 
 
 
507 aa  276  7e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  36.95 
 
 
495 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  36.44 
 
 
517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  37.58 
 
 
528 aa  266  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  35.84 
 
 
517 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  35.99 
 
 
498 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  36.36 
 
 
524 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.26 
 
 
512 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.26 
 
 
512 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  33.77 
 
 
520 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  38.7 
 
 
501 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  32.86 
 
 
462 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  33.33 
 
 
462 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  34.71 
 
 
510 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  34.23 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  34.06 
 
 
510 aa  233  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  33.79 
 
 
527 aa  233  9e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  31.77 
 
 
479 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  30.46 
 
 
461 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  30.63 
 
 
517 aa  225  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  30.06 
 
 
461 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  30.06 
 
 
461 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  30.26 
 
 
461 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  30.06 
 
 
461 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  30.26 
 
 
461 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  29.86 
 
 
461 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  29.86 
 
 
461 aa  224  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  29.86 
 
 
461 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  29.86 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  30.51 
 
 
444 aa  223  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  34.86 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  34.86 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  30.96 
 
 
516 aa  221  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  31.98 
 
 
451 aa  220  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  30.67 
 
 
461 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  30.58 
 
 
432 aa  219  7.999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  32.26 
 
 
489 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  32.26 
 
 
489 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  32.26 
 
 
489 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  32.15 
 
 
490 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  31.81 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.77 
 
 
534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  31.53 
 
 
491 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  30.78 
 
 
501 aa  213  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  30.59 
 
 
501 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  31.68 
 
 
489 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  30.59 
 
 
501 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  30.39 
 
 
501 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  31.35 
 
 
461 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  31.13 
 
 
461 aa  209  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  32.04 
 
 
467 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 
499 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  32.45 
 
 
539 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  32.26 
 
 
539 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  32.45 
 
 
539 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  32.45 
 
 
539 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  30.2 
 
 
463 aa  207  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  33.33 
 
 
502 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  32.11 
 
 
463 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  32.99 
 
 
464 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  31.44 
 
 
504 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  33.41 
 
 
489 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  31.42 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  30.2 
 
 
500 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  32.88 
 
 
516 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  33 
 
 
495 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.62 
 
 
516 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  30.98 
 
 
449 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  32.11 
 
 
452 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  30.96 
 
 
501 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  32.11 
 
 
452 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  31.31 
 
 
533 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  30.75 
 
 
449 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  30.75 
 
 
449 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  31.56 
 
 
544 aa  193  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  30.98 
 
 
449 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  31.28 
 
 
497 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>