299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1881 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  82 
 
 
512 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  82 
 
 
512 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
517 aa  1031    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  91.68 
 
 
517 aa  962    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  62.89 
 
 
528 aa  631  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  53.44 
 
 
507 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  52.96 
 
 
524 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  54.9 
 
 
520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  48.75 
 
 
517 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  48.83 
 
 
516 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  39.41 
 
 
495 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  39.28 
 
 
501 aa  352  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  39.71 
 
 
497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  39.43 
 
 
483 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  40.61 
 
 
498 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  40.67 
 
 
499 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  37.5 
 
 
462 aa  307  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  38.96 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  40.51 
 
 
496 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  36.58 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  37.19 
 
 
497 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  36.96 
 
 
451 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  37.6 
 
 
509 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  38.12 
 
 
495 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  37.42 
 
 
497 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  35.29 
 
 
501 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  35.29 
 
 
501 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  35.48 
 
 
501 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  36.67 
 
 
491 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  35.92 
 
 
489 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0682  di-/tripeptide transporter  42.54 
 
 
360 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0420069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0685  di-/tripeptide transporter  46.91 
 
 
351 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.284877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  36.03 
 
 
483 aa  276  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  34.52 
 
 
527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  35.55 
 
 
446 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  35.55 
 
 
446 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  37.85 
 
 
489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  35.45 
 
 
484 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  35.2 
 
 
501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  36.38 
 
 
498 aa  266  8e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  36.38 
 
 
490 aa  263  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  34.35 
 
 
516 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  35.22 
 
 
504 aa  263  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.2 
 
 
510 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  35.63 
 
 
482 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  35.23 
 
 
510 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.76 
 
 
516 aa  257  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  36.9 
 
 
497 aa  256  9e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  34.54 
 
 
499 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  34.14 
 
 
486 aa  250  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  36.83 
 
 
482 aa  250  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  34.91 
 
 
499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  33.55 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  33.55 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  34.71 
 
 
467 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  32.75 
 
 
494 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  34.98 
 
 
544 aa  240  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  31.77 
 
 
461 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  31.99 
 
 
477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.34 
 
 
534 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  34.43 
 
 
502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  31.9 
 
 
463 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  32.98 
 
 
461 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  32.77 
 
 
461 aa  233  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  32.63 
 
 
461 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  32.63 
 
 
461 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  32.63 
 
 
461 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  32.63 
 
 
461 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  31.98 
 
 
533 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  31.45 
 
 
461 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  32.77 
 
 
461 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  31.45 
 
 
461 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  32.04 
 
 
539 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  31.49 
 
 
539 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  33.01 
 
 
497 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  32.04 
 
 
539 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  34.38 
 
 
544 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  32.63 
 
 
464 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  31.31 
 
 
539 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  32.67 
 
 
449 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  32.46 
 
 
449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  32.06 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  32.06 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  32.47 
 
 
511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  33.76 
 
 
501 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  32.32 
 
 
501 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  31.73 
 
 
452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  31.73 
 
 
452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  32.61 
 
 
463 aa  213  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  31.4 
 
 
492 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  31.2 
 
 
492 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  28.21 
 
 
584 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  30.1 
 
 
495 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  32.14 
 
 
461 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  32.35 
 
 
395 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  31.2 
 
 
461 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  32 
 
 
461 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 
485 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  28.46 
 
 
485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 
485 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>