More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2895 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  84.43 
 
 
489 aa  813    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  85.63 
 
 
501 aa  889    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  99 
 
 
501 aa  1003    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  81.71 
 
 
491 aa  822    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  84.06 
 
 
490 aa  833    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  99.2 
 
 
501 aa  1005    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  86.03 
 
 
501 aa  889    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  82.83 
 
 
489 aa  837    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  83.23 
 
 
500 aa  857    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  85.23 
 
 
489 aa  874    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  85.23 
 
 
489 aa  874    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  85.83 
 
 
489 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  82.33 
 
 
490 aa  827    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
501 aa  1010    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  63.62 
 
 
451 aa  596  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  61.73 
 
 
462 aa  595  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  62.53 
 
 
462 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  86.77 
 
 
324 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  55.35 
 
 
479 aa  531  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  43.9 
 
 
461 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  46.82 
 
 
446 aa  371  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  46.82 
 
 
446 aa  371  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  44.47 
 
 
461 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  44.68 
 
 
461 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  44.68 
 
 
461 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  44.47 
 
 
461 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  44.68 
 
 
461 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  44.47 
 
 
461 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  44.68 
 
 
461 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  44.26 
 
 
461 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  44.05 
 
 
461 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  44.47 
 
 
461 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  46.17 
 
 
461 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  46.17 
 
 
461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  44.33 
 
 
463 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  47.54 
 
 
452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  47.54 
 
 
452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  45.99 
 
 
467 aa  348  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  47.27 
 
 
464 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  45.62 
 
 
463 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  42.4 
 
 
449 aa  346  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  42.83 
 
 
449 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  42.18 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  42.18 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  43.25 
 
 
444 aa  342  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  44.32 
 
 
504 aa  335  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  45.16 
 
 
463 aa  333  6e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  45.54 
 
 
395 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  43.51 
 
 
432 aa  322  7e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  44.42 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3195  peptide transporter  94.29 
 
 
176 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  37.19 
 
 
501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  37.75 
 
 
497 aa  299  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.94 
 
 
510 aa  297  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  37.13 
 
 
510 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  34.68 
 
 
495 aa  289  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  37.99 
 
 
477 aa  286  9e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  36.96 
 
 
499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  35.14 
 
 
517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  35.48 
 
 
517 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  36.42 
 
 
527 aa  278  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  35.59 
 
 
497 aa  277  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  34.7 
 
 
499 aa  276  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  34.24 
 
 
497 aa  276  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  36.9 
 
 
471 aa  273  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  35.86 
 
 
516 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  37.17 
 
 
498 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  34.44 
 
 
501 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  37.18 
 
 
544 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  34.44 
 
 
501 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  34.36 
 
 
495 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  35.25 
 
 
502 aa  262  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  35.92 
 
 
496 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.86 
 
 
512 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.86 
 
 
512 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.73 
 
 
516 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  33.61 
 
 
501 aa  256  7e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  32.66 
 
 
507 aa  256  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  35.04 
 
 
524 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  35.13 
 
 
520 aa  253  6e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  33.75 
 
 
544 aa  252  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.67 
 
 
483 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  36.42 
 
 
558 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  35.08 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  32.82 
 
 
498 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  31.91 
 
 
499 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  33.61 
 
 
497 aa  237  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  41.78 
 
 
533 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  31.59 
 
 
483 aa  229  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  32.16 
 
 
497 aa  226  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  31.03 
 
 
484 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  31.73 
 
 
494 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  30.86 
 
 
603 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  32.03 
 
 
492 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  32.03 
 
 
492 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  30.04 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  29.44 
 
 
500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  29.44 
 
 
500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  32.9 
 
 
489 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  29.44 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>