More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2556 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 484 aa  951    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  55.99 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  56.13 
 
 		 486 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  52.2 
 
 		 482 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  52.75 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  51.91 
 
 		 511 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  44.93 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  42.47 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  41.82 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  42.26 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  39.43 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  37.81 
 
 		 499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  40.17 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  39.02 
 
 		 490 aa  336  7e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  41.76 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  37.84 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  37.84 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  39.79 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  38.11 
 
 		 498 aa  309  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  37.68 
 
 		 496 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  37.42 
 
 		 501 aa  296  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  36.76 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  39.08 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  37.67 
 
 		 501 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  34.93 
 
 		 495 aa  282  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  35.04 
 
 		 507 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  36.45 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  38.1 
 
 		 498 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  36.25 
 
 		 528 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  36.44 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  35.79 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  35.79 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  37.11 
 
 		 520 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  37.33 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  32.43 
 
 		 517 aa  249  7e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  32.22 
 
 		 516 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  34.47 
 
 		 483 aa  247  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  32.78 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  32.42 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  33.13 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  33.13 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  32.06 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  34.98 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  33.67 
 
 		 527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  32.59 
 
 		 490 aa  232  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  32.39 
 
 		 489 aa  232  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  32.19 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  32.19 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  32.48 
 
 		 501 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  31.17 
 
 		 491 aa  230  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  33.86 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  32.04 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  30.97 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  31.63 
 
 		 510 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  31.21 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  31.03 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  29.84 
 
 		 461 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  30.83 
 
 		 501 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  30.83 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  31.19 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  30.75 
 
 		 461 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  30.97 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  30.97 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  30.97 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  30.77 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  30.77 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  30.77 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  30.77 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  30.77 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  30.77 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  31.12 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  30.83 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  31.64 
 
 		 533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  31.88 
 
 		 534 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  31.16 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  30.74 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  32 
 
 		 516 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  30.3 
 
 		 500 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  32.01 
 
 		 444 aa  209  9e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  31.42 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  31.42 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  30.12 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  30.57 
 
 		 463 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  33.2 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.32 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  31.42 
 
 		 471 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  30.86 
 
 		 539 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  30.86 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  30.86 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  30.66 
 
 		 539 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  31.65 
 
 		 544 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  31.34 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  31.34 
 
 		 544 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  30.88 
 
 		 494 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  31.2 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  29.26 
 
 		 449 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  29.26 
 
 		 449 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  26.03 
 
 		 584 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  29.26 
 
 		 449 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  31.62 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>