More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0920 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 436 aa  867    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  49.05 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  46.09 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  44.09 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  43.64 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  45.63 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  45.83 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  45.83 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  46.27 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  45.81 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  45.39 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  43.33 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  44.44 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  45.39 
 
 		 489 aa  363  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  44.44 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  44.66 
 
 		 501 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  44.71 
 
 		 489 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  44.44 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  45.25 
 
 		 463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  42.95 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  43.33 
 
 		 461 aa  348  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  43.54 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  43.11 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  43.11 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  43.11 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  43.11 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  43.11 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  42.83 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  46.77 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  43.11 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  43.11 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  43.11 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  45.78 
 
 		 463 aa  342  9e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  41.54 
 
 		 500 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  43.05 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  42.73 
 
 		 463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  41.45 
 
 		 479 aa  335  7e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  43.05 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  42 
 
 		 504 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  44.34 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  44.34 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  44.34 
 
 		 449 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  42.99 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  44.07 
 
 		 452 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  44.07 
 
 		 452 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  43.71 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  42.74 
 
 		 467 aa  316  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  39.05 
 
 		 527 aa  307  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  44.85 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  37.36 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  34.44 
 
 		 516 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  35.08 
 
 		 497 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  34.15 
 
 		 501 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  36.93 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  36.93 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  35.73 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  33.54 
 
 		 495 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  36.58 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  34.03 
 
 		 544 aa  262  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  34.33 
 
 		 544 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  33.74 
 
 		 497 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  35.28 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  33.47 
 
 		 499 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  35.81 
 
 		 492 aa  259  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  35.81 
 
 		 492 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  32.78 
 
 		 497 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  35.6 
 
 		 510 aa  253  6e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  34.3 
 
 		 498 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  35.46 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.68 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  32.22 
 
 		 495 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  44.23 
 
 		 324 aa  246  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  32.72 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  32.59 
 
 		 509 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  32.58 
 
 		 524 aa  239  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  32.16 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  34.3 
 
 		 520 aa  236  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  32.02 
 
 		 483 aa  236  8e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  33.49 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  33.33 
 
 		 502 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  32.67 
 
 		 512 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  32.67 
 
 		 512 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  34.38 
 
 		 497 aa  230  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  32.39 
 
 		 499 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  32.42 
 
 		 482 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  29.57 
 
 		 493 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  29.57 
 
 		 493 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  29.57 
 
 		 493 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  29.57 
 
 		 493 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  30.32 
 
 		 493 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  31.25 
 
 		 499 aa  220  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  30.54 
 
 		 493 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  31.06 
 
 		 490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  30.32 
 
 		 493 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  30.32 
 
 		 493 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  30.32 
 
 		 493 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  30.32 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  29.35 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  30.32 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  30.32 
 
 		 493 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>