294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0834 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 499 aa  1002    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  48.47 
 
 		 509 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  47.76 
 
 		 496 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  42.46 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  42.28 
 
 		 497 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  43.28 
 
 		 498 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  40.37 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  39.16 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  39.16 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  40.96 
 
 		 497 aa  362  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  42.36 
 
 		 498 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  40.04 
 
 		 498 aa  355  7.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  41.56 
 
 		 483 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  39.31 
 
 		 499 aa  346  5e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  39.06 
 
 		 490 aa  345  8e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  42.37 
 
 		 497 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  41.43 
 
 		 501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  44.26 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  41.36 
 
 		 495 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  37.4 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  38.12 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  39.3 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  36.83 
 
 		 501 aa  325  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  38.77 
 
 		 507 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  40.67 
 
 		 517 aa  312  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  40 
 
 		 517 aa  310  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  39.92 
 
 		 482 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  40.38 
 
 		 528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  36.46 
 
 		 486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  39.11 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  38.06 
 
 		 524 aa  298  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  35.7 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  34.9 
 
 		 479 aa  296  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  35.95 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  37.05 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  36.6 
 
 		 491 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  37.09 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  37.09 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  35.38 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  38.34 
 
 		 489 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  35.77 
 
 		 510 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  35.38 
 
 		 462 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  36.03 
 
 		 517 aa  289  8e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  37.77 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  36.03 
 
 		 516 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  36.25 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  36.06 
 
 		 489 aa  286  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  36.06 
 
 		 489 aa  286  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  39.87 
 
 		 512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  39.87 
 
 		 512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  35.29 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  35.53 
 
 		 489 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.49 
 
 		 516 aa  282  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  34.28 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  36.24 
 
 		 516 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  34.89 
 
 		 501 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  34.89 
 
 		 501 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  34.7 
 
 		 501 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  36.4 
 
 		 527 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  38.35 
 
 		 432 aa  272  9e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  32.92 
 
 		 451 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  31.79 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  36.38 
 
 		 504 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  36.11 
 
 		 501 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  35.4 
 
 		 494 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  33.26 
 
 		 461 aa  263  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  33.33 
 
 		 461 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  34.24 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  34.97 
 
 		 502 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  33.67 
 
 		 444 aa  257  4e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  33.98 
 
 		 500 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  33.21 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  31.67 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  34.49 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  34.14 
 
 		 471 aa  253  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  33.62 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  33.62 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  33.05 
 
 		 520 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  31.82 
 
 		 463 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  34.19 
 
 		 544 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  36.38 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  29.82 
 
 		 501 aa  243  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  29.82 
 
 		 501 aa  243  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  29.62 
 
 		 501 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  29.62 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  29.62 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.05 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  33.58 
 
 		 539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  33.39 
 
 		 539 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  33.58 
 
 		 539 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  33.15 
 
 		 539 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  30.1 
 
 		 502 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  31.65 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  31.65 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  33.2 
 
 		 544 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  31.65 
 
 		 461 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  31.65 
 
 		 461 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  31.65 
 
 		 461 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  31.65 
 
 		 461 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>