More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6851 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 498 aa  974    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  49.29 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  46.06 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  44.91 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  43.06 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  41.97 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  45.51 
 
 		 496 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  43.27 
 
 		 509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  41.75 
 
 		 517 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  42.94 
 
 		 528 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  40.95 
 
 		 517 aa  355  8.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  44.77 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  41.68 
 
 		 527 aa  343  5.999999999999999e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  40.53 
 
 		 497 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  41.98 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  42.26 
 
 		 497 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  40.64 
 
 		 512 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  40.64 
 
 		 512 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  39.48 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  40.97 
 
 		 451 aa  329  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  40.76 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  39.32 
 
 		 524 aa  323  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  41.75 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  40.92 
 
 		 495 aa  316  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  37.58 
 
 		 517 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  37.25 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  37.25 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  36.42 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  39.72 
 
 		 489 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  38.46 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  39.32 
 
 		 491 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  38.92 
 
 		 489 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  43.61 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  39.88 
 
 		 490 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  37.83 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  38.12 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  38.86 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  38.72 
 
 		 489 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  38.72 
 
 		 489 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  37.93 
 
 		 516 aa  299  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  38.48 
 
 		 501 aa  299  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  40.93 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  37.75 
 
 		 544 aa  297  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  39.78 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  39.23 
 
 		 501 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  40.69 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  39.23 
 
 		 501 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  39.23 
 
 		 501 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  38.22 
 
 		 497 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  38.16 
 
 		 510 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  39.52 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  39.3 
 
 		 504 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  37.68 
 
 		 499 aa  292  8e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  39.71 
 
 		 544 aa  292  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  39.87 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  38.07 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  38.6 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  34.77 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  35.67 
 
 		 539 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  35.28 
 
 		 539 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  35.96 
 
 		 539 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  36.59 
 
 		 533 aa  279  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  35.48 
 
 		 539 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  37.47 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  36.9 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  36.87 
 
 		 498 aa  276  4e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  33.8 
 
 		 501 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  38.75 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  35.51 
 
 		 486 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  35.73 
 
 		 482 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  37.35 
 
 		 502 aa  262  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  32.93 
 
 		 494 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  33.11 
 
 		 584 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  34.14 
 
 		 497 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  34.64 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  39.8 
 
 		 603 aa  223  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  36.41 
 
 		 603 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  31.17 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  34.02 
 
 		 584 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  30.97 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  32.99 
 
 		 558 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0374  amino acid/peptide transporter  35.8 
 
 		 627 aa  203  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  33.48 
 
 		 520 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  28.69 
 
 		 514 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  30.44 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  30.44 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  28.17 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  30.44 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  30.44 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  30.44 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  48.39 
 
 		 446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  48.39 
 
 		 446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  30.53 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  30.67 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  29.98 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  36.36 
 
 		 324 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  30.31 
 
 		 485 aa  200  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  30.54 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  28.34 
 
 		 506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  30.54 
 
 		 528 aa  197  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>