295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0955 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  66.67 
 
 		 499 aa  666    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 510 aa  1007    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  98.43 
 
 		 510 aa  993    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  65.1 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  37.13 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  37.13 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  37.13 
 
 		 489 aa  306  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  39.14 
 
 		 501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  37.52 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  37.85 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  36.53 
 
 		 490 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  36.94 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  37.13 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  36.94 
 
 		 501 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  36.94 
 
 		 501 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  35.95 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  36.15 
 
 		 501 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  36.18 
 
 		 527 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  35.83 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  37.67 
 
 		 489 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  37.77 
 
 		 462 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  38.42 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  36.66 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  34.48 
 
 		 544 aa  280  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  37.17 
 
 		 462 aa  279  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  37.8 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  36.98 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  34.75 
 
 		 516 aa  272  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  33.75 
 
 		 544 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  36.13 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  34.85 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  36.13 
 
 		 479 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  36.12 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  36.01 
 
 		 507 aa  263  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  35.84 
 
 		 517 aa  263  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  37.47 
 
 		 461 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  36.7 
 
 		 461 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  34.81 
 
 		 495 aa  263  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  36.73 
 
 		 497 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  36.2 
 
 		 517 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  33.92 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  36.84 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  38.8 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  38.58 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  36.09 
 
 		 463 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  38.58 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  38.58 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  38.58 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  36.27 
 
 		 497 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  38.58 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  38.58 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  38.58 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  38.14 
 
 		 461 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  35.24 
 
 		 498 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  37.92 
 
 		 461 aa  253  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  37.87 
 
 		 464 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  34.46 
 
 		 497 aa  250  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  32.11 
 
 		 603 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  34.67 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  35.76 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  35.76 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  37.25 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  37.25 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  37.53 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.82 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.82 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  34.13 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  35.38 
 
 		 495 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  37.58 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  37.58 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  37.67 
 
 		 477 aa  239  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  33.46 
 
 		 495 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  33.92 
 
 		 509 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  32.38 
 
 		 490 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  34.59 
 
 		 483 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  31.32 
 
 		 539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  37.14 
 
 		 449 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  31.14 
 
 		 539 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  34.23 
 
 		 517 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  34.48 
 
 		 516 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  31.5 
 
 		 539 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  36.91 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  33.93 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  35.93 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  31.51 
 
 		 539 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.64 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  31.89 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  31.89 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  37.79 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.92 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  31.89 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  31.89 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  31.89 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  31.89 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  31.89 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  31.89 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  31.89 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  33.8 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  29.66 
 
 		 584 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  31.56 
 
 		 490 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>