274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03298 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  100 
 
 
489 aa  979    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  99.8 
 
 
489 aa  978    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  99.8 
 
 
489 aa  978    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  88.34 
 
 
490 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  88.34 
 
 
490 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  87.93 
 
 
490 aa  891    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  99.8 
 
 
489 aa  978    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  99.39 
 
 
489 aa  976    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  99.59 
 
 
489 aa  974    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  88.34 
 
 
490 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  979    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  88.34 
 
 
490 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  100 
 
 
489 aa  979    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  99.8 
 
 
489 aa  977    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  54.26 
 
 
495 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  52.18 
 
 
500 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  52.18 
 
 
500 aa  514  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  52.18 
 
 
500 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  50.92 
 
 
501 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  50.72 
 
 
501 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  52.18 
 
 
500 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  50.51 
 
 
501 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  52.18 
 
 
500 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  52.18 
 
 
500 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  52.18 
 
 
500 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  52.18 
 
 
500 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  50.72 
 
 
501 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  50.92 
 
 
501 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  52.18 
 
 
500 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  51.33 
 
 
506 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  51.57 
 
 
506 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  51.56 
 
 
502 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  52.27 
 
 
488 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  51.72 
 
 
511 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  51.72 
 
 
501 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  48.16 
 
 
514 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  51.46 
 
 
506 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  48.22 
 
 
500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  47.8 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  45.4 
 
 
528 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  45.19 
 
 
504 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  39.88 
 
 
506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  38.95 
 
 
517 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  37.88 
 
 
516 aa  346  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  37.88 
 
 
516 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  37.88 
 
 
516 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  37.88 
 
 
546 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  38.54 
 
 
523 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  37.24 
 
 
507 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  38.25 
 
 
513 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  38.54 
 
 
521 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  38.54 
 
 
517 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  37.47 
 
 
516 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  38.46 
 
 
513 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  37.45 
 
 
551 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  37.04 
 
 
551 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  37.04 
 
 
500 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  37.04 
 
 
500 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  37.24 
 
 
506 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  36.84 
 
 
500 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  36.84 
 
 
500 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  36.84 
 
 
500 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  36.84 
 
 
500 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  37.12 
 
 
506 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  37.34 
 
 
506 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  37.34 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  37.34 
 
 
507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  37.12 
 
 
506 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  37.12 
 
 
506 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  33.81 
 
 
492 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  33.61 
 
 
492 aa  253  7e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1189  amino acid/peptide transporter  34.83 
 
 
501 aa  252  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.500547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  31.57 
 
 
527 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  31.89 
 
 
510 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  31.48 
 
 
510 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  29.9 
 
 
516 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  29.9 
 
 
516 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  32.99 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  27.62 
 
 
494 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  30.83 
 
 
444 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  30.16 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  28.85 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  30.55 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  31.59 
 
 
524 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  27.61 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  29.55 
 
 
501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  28.26 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  28.26 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  29.55 
 
 
501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  28.29 
 
 
517 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  28.27 
 
 
501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0783  di/tripeptide transporter homolog IraB  28.57 
 
 
502 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  27.92 
 
 
544 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  29.12 
 
 
501 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  28.35 
 
 
517 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  25.91 
 
 
534 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  27.33 
 
 
490 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  28.35 
 
 
490 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0812  di/tripeptide transporter homolog IraB  28.36 
 
 
502 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  29.75 
 
 
462 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>