279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2795 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  99.44 
 
 		 539 aa  1074    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 539 aa  1079    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  83.01 
 
 		 534 aa  875    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  98.89 
 
 		 539 aa  1068    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  99.26 
 
 		 539 aa  1072    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  51.02 
 
 		 544 aa  492  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  50.28 
 
 		 544 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  45.88 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  45.05 
 
 		 516 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  58.36 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  38.9 
 
 		 603 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  41.47 
 
 		 527 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  33.95 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0374  amino acid/peptide transporter  32.3 
 
 		 627 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  35.24 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  33.65 
 
 		 497 aa  267  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  36.02 
 
 		 497 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  33.21 
 
 		 495 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  35.02 
 
 		 498 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  35.14 
 
 		 497 aa  259  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  33.14 
 
 		 492 aa  259  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  32.94 
 
 		 492 aa  258  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  32.76 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  35.24 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  33.79 
 
 		 504 aa  246  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  33.94 
 
 		 499 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  32.81 
 
 		 495 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  32.43 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  32.84 
 
 		 507 aa  238  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  31.5 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  34.11 
 
 		 483 aa  238  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  33.61 
 
 		 517 aa  236  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  32.75 
 
 		 533 aa  236  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  31.77 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  29.09 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  34.09 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  31.85 
 
 		 517 aa  230  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  35.08 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  35.08 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  33.46 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  32.11 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  32.52 
 
 		 528 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  31.05 
 
 		 512 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  31.05 
 
 		 512 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  30.66 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  32.04 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  29.18 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  31.05 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  31.5 
 
 		 498 aa  220  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  31.62 
 
 		 501 aa  220  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  31.62 
 
 		 501 aa  220  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  32.2 
 
 		 501 aa  220  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  33.15 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  30.94 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.73 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  31.05 
 
 		 558 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  31.61 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  30.28 
 
 		 517 aa  210  6e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  26.53 
 
 		 501 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  26.53 
 
 		 501 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  26.53 
 
 		 501 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  26.53 
 
 		 501 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  26.53 
 
 		 501 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  29.12 
 
 		 493 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  31.94 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  31.94 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  29.12 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  30.86 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  29.12 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 		 493 aa  208  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  29.9 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 		 493 aa  208  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  27.12 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 		 493 aa  206  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  28.71 
 
 		 493 aa  206  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  30.86 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  30.86 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  30.86 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  30.86 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  30.13 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  31.71 
 
 		 482 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  30.86 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  29.09 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  29.09 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  29.09 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  29.98 
 
 		 524 aa  204  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  32.49 
 
 		 500 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  30.63 
 
 		 489 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  30.37 
 
 		 485 aa  203  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  30.37 
 
 		 485 aa  203  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  30.37 
 
 		 485 aa  203  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  27.64 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  30.69 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  30.37 
 
 		 485 aa  202  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  30.37 
 
 		 485 aa  202  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  30.64 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  30.64 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>