More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3647 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  100 
 
 		 479 aa  962    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  57.42 
 
 		 462 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  55.35 
 
 		 501 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  55.15 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  55.15 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  54.87 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  54.66 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  54.66 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  54.49 
 
 		 490 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  53.54 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  55.17 
 
 		 490 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  56.7 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  54.23 
 
 		 491 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  52.54 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  54.23 
 
 		 489 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  55.33 
 
 		 451 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  51.92 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  54.13 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  46.61 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  46.61 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  46.61 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  46.61 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  46.27 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  46.39 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  46.05 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  46.39 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  46.39 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  46.49 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  44.93 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  48.18 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  47.94 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  48.19 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  45.39 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  47.95 
 
 		 463 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  48.3 
 
 		 452 aa  359  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  48.3 
 
 		 452 aa  359  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  45.24 
 
 		 504 aa  355  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  45.62 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  45.74 
 
 		 449 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  46.28 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  45.52 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  45.52 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  43.23 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  54.57 
 
 		 324 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  42.86 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  42.86 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  47.86 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  49.61 
 
 		 395 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  44.23 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  39.04 
 
 		 501 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  41.45 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  37.27 
 
 		 498 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  34.9 
 
 		 499 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  36.85 
 
 		 509 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  38.81 
 
 		 527 aa  293  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  35.13 
 
 		 497 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  35.93 
 
 		 497 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  34.75 
 
 		 495 aa  287  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  38.72 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  36.51 
 
 		 477 aa  280  4e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  38.72 
 
 		 471 aa  277  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  37.65 
 
 		 524 aa  276  8e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  32.67 
 
 		 495 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  37.97 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  36.58 
 
 		 544 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  37.65 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  37.81 
 
 		 490 aa  270  5e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  36.81 
 
 		 516 aa  269  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  39.96 
 
 		 544 aa  269  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  36.02 
 
 		 499 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.58 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.58 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.13 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  35.33 
 
 		 510 aa  263  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.81 
 
 		 483 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  35.81 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  31.87 
 
 		 501 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  31.87 
 
 		 501 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  33.4 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  39.48 
 
 		 533 aa  246  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  32.16 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  32.78 
 
 		 484 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  31.98 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  33.19 
 
 		 497 aa  236  6e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  36.05 
 
 		 558 aa  232  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  31.65 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  30.45 
 
 		 499 aa  229  7e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  31.6 
 
 		 501 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  31.49 
 
 		 498 aa  226  7e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  32.89 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  33.54 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  32.92 
 
 		 492 aa  222  9e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  33.26 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  30.58 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  33.19 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  32.43 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  30.22 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  26.75 
 
 		 506 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  27.47 
 
 		 506 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  45.78 
 
 		 496 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>