More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3037 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  86.23 
 
 		 501 aa  894    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  82.11 
 
 		 491 aa  824    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  85.03 
 
 		 489 aa  817    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  86.63 
 
 		 501 aa  893    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 501 aa  1009    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  82.63 
 
 		 489 aa  835    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  84.06 
 
 		 490 aa  835    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  83.03 
 
 		 500 aa  855    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  85.43 
 
 		 489 aa  874    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  85.43 
 
 		 489 aa  874    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  86.03 
 
 		 489 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  82.53 
 
 		 490 aa  826    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  99.8 
 
 		 501 aa  1009    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  99.2 
 
 		 501 aa  1005    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  64.04 
 
 		 451 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  62.14 
 
 		 462 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  87.08 
 
 		 324 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  62.95 
 
 		 462 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  55.15 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  46.82 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  46.82 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  43.9 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  44.05 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  44.26 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  44.26 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  44.26 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  44.26 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  46.17 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  44.05 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  44.05 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  43.84 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  43.63 
 
 		 461 aa  363  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  46.17 
 
 		 461 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  44.05 
 
 		 461 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  44.33 
 
 		 463 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  47.54 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  47.54 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  45.85 
 
 		 463 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  45.78 
 
 		 467 aa  350  5e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  47.45 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  42.83 
 
 		 449 aa  346  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  42.4 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  42.18 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  42.18 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  43.67 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  45.39 
 
 		 463 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  44.32 
 
 		 504 aa  335  9e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  45.54 
 
 		 395 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  43.07 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  44.21 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3195  peptide transporter  94.29 
 
 		 176 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  37.57 
 
 		 501 aa  312  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  37.55 
 
 		 497 aa  299  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.94 
 
 		 510 aa  295  9e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  37.13 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  34.68 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  36.76 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  37.8 
 
 		 477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  34.95 
 
 		 517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  35.29 
 
 		 517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  36.8 
 
 		 527 aa  280  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  34.89 
 
 		 499 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  35.59 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  34.62 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  37.11 
 
 		 471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  36 
 
 		 516 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  36.96 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  34.62 
 
 		 495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  37.43 
 
 		 544 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  34.32 
 
 		 501 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  34.32 
 
 		 501 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.48 
 
 		 512 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.48 
 
 		 512 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  34.85 
 
 		 502 aa  259  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  35.88 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  32.86 
 
 		 507 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  35.04 
 
 		 524 aa  257  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.94 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  34.94 
 
 		 520 aa  253  6e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  33.47 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  33.63 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.67 
 
 		 483 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  35.51 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  35.85 
 
 		 558 aa  246  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  32.89 
 
 		 498 aa  246  8e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  31.91 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  34.03 
 
 		 497 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  41.51 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  31.4 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  32.49 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  30.83 
 
 		 484 aa  222  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  31.37 
 
 		 603 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  31.53 
 
 		 494 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  31.94 
 
 		 516 aa  216  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  31.82 
 
 		 492 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  31.82 
 
 		 492 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  33.12 
 
 		 489 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  30.04 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  32.75 
 
 		 445 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  29.44 
 
 		 500 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>